Las escenas grabadas en sus monumentos ayudan a entender la vida de esta antigua ciudad. Su arte es con claridad la transición entre el olmeca y el maya; los artistas de Izapa evidentemente pasaron a los mayas de México y Guatemala el complejo altar-estela ya que el arte que contienen representa un paso en la evolución del arte olmeca al arte maya que se desarrolló posteriormente.

Las estelas acompañadas de altares, como lo hicieron los Olmecas, fueron esculpidas con escenas narrativas y rituales que constituyen el antecedente directo de la temática del arte maya y de los principales conceptos religiosos.

 Izapa fue un centro ceremonial y a sus habitantes se les debe el cultivo y uso del fruto que fuera de gran relevancia en la América Precolombina: el cacao.

En la zona también se encuentra cerámica vidriada, única en mesoamérica, que comparte muchas características con la realizada en las costas del Ecuador.

Dentro de los principales hallazgos, se conservan verdaderas joyas artísticas como: El Árbol de la Vida, La Piedra de los Sacrificios, un calendario con jeroglíficos de estrellas y soles, varias estelas, esculturas zoomorfas y un juego de pelota.

En las estelas puede observarse el rito de la decapitación de los jugadores de pelota; adoración de las plantas como la ceiba y el cocodrilo como el símbolo de la tierra; deidades o personajes descendentes, con disfraces de pájaros, cabezas de serpientes, etc.

La estructura ceremonial en Izapa está distribuida en plazas rectangulares, también existen patios, plataformas para casas o habitaciones y terrazas, lo mismo que montículos funerarios. Conocen el uso de la rampa.

En relación con la arquitectura aparecen en Izapa figuras zoomorfas, ranas y felinos, lo mismo en las estelas lisas o con relieves, colocadas al frente de los basmentos y plataformas. 

Algunas estelas muestran en la parte superior una banda con motivos felinos seguida de una escena principal, con escenas religiosas o costumbristas, y por último, otra banda relacionada con la tierra o el agua.

La construcción de basamentos y templos se liga a la religión y al sacerdocio. Se rinde culto a las deidades de la lluvia, la tierra y de las labores agrícolas. Se poseen conceptos sobre la muerte y el inframundo.

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